Центрально-Черноземная область, образованная в 1928 году, просуществовавшая до 1934 года, Постановлением Президиума ВЦИК от 13 июня 1934 г. была разделена на Воронежскую и Курскую области. Алексеевский район, в составе которого находился Алейниковский сельский совет, вошел в состав Воронежской области. Во время Великой Отечественной войны деятельность Алейниковского сельского Совета была приостановлена, а в 1943 году, после освобождения от немецкой оккупации Алексеевского района, возобновлена.
Указом президиума Верховного Совета РСФСР от 06 января 1954 года Алексеевский район, в том числе Алейниковский сельский Совет депутатов трудящихся, вошли в состав вновь образованной Белгородской области.
В соответствии с новой Конституцией СССР от 01 октября 1977 года Алейниковский сельский Совет депутатов трудящихся стал называться Алейниковским сельским Советом народных депутатов.
В Алейниковский сельский округ входят: с. Алейниково, с. Славгородское, х. Новоселовка, х. Волков.
Начиная с 2005 года в соответствии с конституционными гарантиями самоуправления в РФ, федеральными и областными законами в Белгородской области приняты Уставы муниципальных образований, а также утверждена административно-территориальная структура муниципальных образований. Решением Совета депутатов Алексеевского района и города Алексеевки от 25.10.2005 года №2 образованы администрации сельских поселений, в том числе и администрация Алейниковского сельского поселения.
27 сентября 2018 года Советом депутатов Алексеевского городского округа Белгородской области первого созыва было принято решение №15 «О ликвидации земского собрания Алейниковского сельского поселения как юридического лица», а 18 декабря 2018 года Советом депутатов Алексеевского городского округа первого созыва было принято решение №15 «О ликвидации Алейниковского сельского поселения как юридического лица».
20 декабря 2018 года Совет депутатов Алексеевского городского округа первого созыва принял решение №5 «О создании Алейниковской территориальной администрации администрации Алексеевского городского округа».
24 сентября 2024 года Совет депутатов Алексеевского муниципального округа принял решение №10 «О внесении изменений в решение Совета депутатов Алексеевского городского округа от 20 декабря 2018 года № 5 «О создании Алейниковской территориальной администрации администрации Алексеевского городского округа»».
В состав территории входят следующие населенные пункты: село Алейниково, хутор Новоселовка и село Славгородское.